แต่เดิมการจัดทำบัญชีของกรมตำรวจหรือสำนักงานตำรวจแห่งชาติ เป็นหน้าที่โดยตรงของกองการเงิน (แผนกบัญชี) ซึ่งเป็นหน้าที่ความรับผิดชอบของฝ่ายบัญชีกรม ต่อมามีการปรับเปลี่ยนโครงสร้างหลายครั้ง ทำให้ภาระหน้าที่การบัญชีส่วนนี้ขาดตอนไปอยู่หลายแผนกไม่มีบัญชีภาพรวมของส่วนราชการ จนได้แบ่งส่วนราชการเป็น ฝ่ายการเงิน 1 สังกัดกองการเงิน เมื่อปี พ.ศ. 2548 มีหน้าที่และความรับผิดชอบเกี่ยวกับการ

• จัดทำฐานข้อมูลบัญชีภาพรวม ฐานข้อมูลการเบิกจ่ายเงินเดือน ค่าจ้างของข้าราชการตำรวจ พนักงานราชการและลูกจ้าง ฐานข้อมูลการเบิกจ่ายบำเหน็จบำนาญ ประมวลผลทางบัญชี
• จัดทำรายงานทางการเงินของสำนักงานตำรวจแห่งชาติ

และครั้งหลังสุดได้มีพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการสำนักงานตำรวจแห่งชาติ พ.ศ.2552 โดยมีผลใช้บังคับตั้งแต่ วันที่ 7 กันยายน 2552 ให้แบ่งส่วนราชการสำนักงานตำรวจแห่งชาติ ส่วนสำนักงานผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติเป็นส่วนราชการที่มีฐานะเทียบเท่ากอง บัญชาการ ได้แก่สำนักงานงบประมาณและการเงิน ประกอบด้วย

• กองการเงิน
• กองงบประมาณ
• กองบัญชี

ฝ่ายการเงิน 1 จึงถูกตัดโอนจากกองการเงินมาเป็นกองบัญชี เป็นกองบังคับการที่ตั้งขึ้นใหม่ มีหน้าที่และความรับผิดชอบเกี่ยวกับการจัดทำบัญชีและต้นทุนผลผลิต การจัดทำบัญชีสินทรัพย์ในภาพรวมของกองบัญชาการและของสำนักงานตำรวจแห่งชาติ การติดตามสถานะการเงินและงบประมาณในระบบอิเล็กทรอนิกส์ (GFMIS) เพื่อให้สอดคล้องกับแนวนโยบายการบริหารราชการแผ่นดิน ที่เน้นการจัดระบบการบริหารราชการให้มีขอบเขตอำนาจหน้าที่และตรวจสอบได้ ตามบทบัญญัติของรัฐธรรมนูญแห่งราชอาณาจักรไทย พ.ศ. 2550

โครงสร้างของกองบัญชีประกอบด้วยฝ่ายต่างๆ (เทียบเท่าระดับกองกำกับการ) รวม 4 ฝ่ายดังนี้ ฝ่ายอำนวยการ ฝ่ายบัญชี 1 ฝ่ายบัญชี 2 และฝ่ายบัญชี 3 แต่ละฝ่ายทำหน้าที่ตามราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการ พ.ศ. 2552 มีโครงสร้างตำแหน่งรวมทั้งสิ้น 59 ตำแหน่ง ผู้บังคับการ 1 ตำแหน่ง เป็นหัวหน้าหน่วยงาน รองผู้บังคับการ 2 ตำแหน่ง ผู้กำกับการ 4 ตำแหน่ง รองผู้กำกับการ 4 ตำแหน่ง สารวัตรรวม 8 ตำแหน่ง รองสารวัตร 16 และชั้นประทวน 24 ตำแหน่ง

พล.ต.ต.เกรียงศักดิ์ ไทพาณิชย์ เป็นผู้บังคับการกองบัญชีสำนักงานงบประมาณและการเงินคนแรก ปฏิบัติหน้าที่ให้บริการด้านวิชาการความรู้และการปฏิบัติด้านบัญชีแก่หน่วยต่างๆ โดยส่วนใหญ่จะปฏิบัติการผ่านระบบการคลังทางอิเล็กทรอนิกส์ GFMIS (Government Fiscal Management Information System) ตั้งแต่ ก.ย. 2552 จนถึง 30 ก.ย.2555

มีอำนาจหน้าที่ดังต่อไปนี้

• ดำเนินการและพัฒนาเกี่ยวกับงานการบัญชีของสำนักงานตำรวจแห่งชาติ
• ดำเนินการด้านวิชาการและฝึกอบรมด้านการบัญชีให้หน่วยงานต่าง ๆ ในสำนักงานตำรวจแห่งชาติ
• ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

ทำเนียบผู้บริหารกองบัญชี สำนักงานงบประมาณและการเงิน สำนักงานตำรวจแห่งชาติ